Записывая свой «первенец», «Апокалиптика» не ожидала успеха и продолжения этого эксперимента. И ребята решают продолжать. На подходе был второй альбом, и «Апокалиптика» перед его выходом выпускает сингл - «Harmageddon» - который содержал первую песню «Апокалиптики», а не кавер, и понимающие люди уже зациклили на «repeat» первый трек сингла - Harmageddon. А потом выходит второй альбом - «Inquisition Symphony» («Симфония инквизиции»), на нём Metallica (четыре песни), Sepultura (два трека) (среди них - самая тяжёлая вещь, которую исполняет «Апокалиптика» - Refuse, Resist) и по одному - Pantera и Faith No More, а также три вещи, написанные Эйккой (Harmageddon, M.B.(Metal Boogie), Toreador). Альбом вышел гораздо тяжелее и агрессивнее, а сыграно всё просто гениально. После выхода группа отправляется на гастроли. Теперь группа занимает очень много времени - Макс и Эйкка уходят в академический отпуск, а потом и Пааво, и Антеро тоже выходят в академический отпуск…

Итак, 2000-ый. Во время записи альбома в группе происходит замена. Группу покидает Антеро и приходит Пертту Кивилааксо, кумир всех фанаток группы т. к. холостой. Антеро уходит вполне мирно, заблаговременно подыскав себе замену - Антеро больше нравится карьера классического музыканта, а он - метал-звезда… Он закончил Академию имени Яна Сибелиуса уже в конце 1999. И вот он - «Cult» («Культ») - лучший альбом группы, хотя нет лучший, надеюсь ещё впереди. А на нём: две песни «Металлики», одна классическая пьеса («В пещере горного короля» (Hall of the Mountain King) Эдварда Грига, который каждый раз переворачивается в гробу при её исполнении), а также - десять офигеннейших песен Эйкки. И вот уже у очень многих в графе любимый композитор стоит «Топпинен»… Каверы особого внимания не заслуживают. Также Эйкка записал для альбома партию контрабаса. Титаническая работа на студии видна невооружённым взглядом. Один из главных секретов «Культа» - очень много виолончелей - чуть ли не 100. Официальный релиз – 25 октября.

А потом, для одних трагедия, для других радость, а для третьих – просто эксперимент, выпущенный в виде сингла – Path vol. 2 feat. Sandra Nasic (Guano Apes) (Path том второй в соавторстве с Сандрой Назич (Guano Apes). В душах поклонников он остался как эксперимент и как первый блин – комом.

Также в 2001 году «Апокалиптика» песню «Апокалиптики» с вокалом – Hope vol. 2 feat. Matthias Sayer (Farmerboys). Выходят синглы на Path vol. 2 и Hope vol.2. На сингле(Hope vol. 2) также присутствуют две интересные вещи, записанные для «Inquisition Symphony», но не попавшие на диск – South of Heaven & Mandatory Suicide (Slayer) и My Friend of Misery (Metallica). После выхода «Культа» «Апокалиптика» издаёт концерт (Live in Munich (Мюнхен)).

В поддержку альбома «Апокалиптика» даёт гигантский тур. Около 200 концертов менее чем за 2 года. В декабре 2002 года, во время созидания “Reflections”, группу покидает Макс Лилья. Он после этого очень тяжелого времени перестал находить общий язык с Эйккой. Эйкка говорит, что покинет группу, но так как без Эйкки это была бы не «Апокалиптика», Макс уходит из группы.

Месяц абсолютного молчания от группы. Все СМИ уже раструбили об уходе Макса, а поклонники группы тихо глотают валидол и седеют. И вот заявление Эйкки: «Группа продолжает втроём, вопрос о замене пока не стоит, но Эйкка слёзно просит вернуться Антеро. Он отказывается, но обещает помочь на живых шоу. Он поучаствует в записи некоторых треков альбома, который пока еще не созрел в голове Эйкки…»

И вот уже рецензенты о новом альбоме только начали брызгать слюной и соплями, как выходит, в общем-то, ожидаемая, Faraway vol. 2 feat. Linda Sundblad (Lambretta, Швеция). Faraway – шикарнейшая баллада, с фортепиано (хотя многие считают, что когда этот же ход, что играет фортепиано, играется пиццикато на виолончелях, то звучит лучше), простая до гениальности, очень мелодичная и певучая, так и напрашивалась на vol. 2. Но результат разочаровал многих. А вот лирика, написанная Линдой и ещё одним кадром (Брэди Блэйд (Brady Blade)), отличная. На сингле Faraway vol.2 присутствует также ещё одна песня, написанная Пертту, Perdition – классная возвышенная вещь, очень оригинальная.

После записи альбома «Апокалиптика» отправляется в тур, в котором участвуют два неофициальных члена «Апокалиптики» – Антеро Маннинен и Микка Сирен (Mikko Siren (ударные)). Антеро мотается между «Апокалиптикой» и работой, так что иногда всё же «Апокалиптике» приходилось играть «на трёх виолончелях», и на нескольких шоу отсутствовал Пааво, и Эйкка отмазывался: “Tonight we are only three cellos, because Paavo became father this week”. Во время передышки в туре группа записывает кавер на старую песню Rammstein’а - Seemann (Apocalyptica feat. Nana Hagen - Seemann). Это первый кавер «Апокалиптики» с вокалом, и первая песня с вокалом без vol. 2. Вокал исполнила пенсионерка панк-рока, фанатами которой являются Горшок и Князь («Король и шут») – Нина Хаген (Nina Hagen). В конце 2003-го выходит “Reflections Revised” – версия “Reflections” со всеми бонусами синглов, а также с DVD-диском, с тремя клипами, интервью и несколькими видео с живых шоу – очень интересная вещь (хотя mp3 с аудио диска можно найти в Интернете, то огромный интерес имеет DVD).

Долгое затишье до ноября 2004-го. А потом – шокирующая новость: «Апокалиптика» записывает сингл (Bittersweet) в соавторстве с Ville Valo (HIM) и Lauri Ylonen (The Rasmus). Обе эти личности поют легковатый метал, иногда встречающийся даже в фонотеках любителей попсы… Поклонники «Апокалиптики» уже не просто седеют, а уже теряют волосы. Но а результат – отличная баллада, за которою некоторые недалёкие личности будут обвинять «Апокалиптику» в «опопсении», даже не послушав её. Также на сингле присутствует (кроме нескольких версий Bittersweet) – Miscontruction – она полна уже не электричества, а красивых и оригинальных эффектов. А больше всего она определяется как гармоничный гибрид «Культа» и «Размышлений». Если такой будет вся пятёрочка, то она, скорей всего, перебьёт «его величество «Культ». Он выйдет 24 января 2005-го, и называется очень просто – “Apocalyptica”.

После выхода альбома (14 февраля) следует издание ещё одного сингла - “Wie Weit”. Это Quutamo (инструментальная версия) и три версии этой песни с вокалом на разных языках. На английском (How Far) и немецких (Wei Weit) языках лирику исполнила Marta Jandova (Die Happy, Германия). Французкая версия - En Vie уже известна. В апреле следует ещё один сингл - Life Burns.

«Апокалиптика» записывает песню, сочинённую мастером рингтонов Шелыгиным – саундтрек к фильму «Бой с тенью»…

Все композиции с участием вокалистов, издававшиеся ранее на синглах, вошли в 2006 году в юбилейный сборник Amplified: a Decade of Reinventing the Cello, посвящённый десятилетию концертной деятельности группы.

В 2007 году Apocalyptica записала альбом Worlds Collide, в котором приняли участие Тиль Линдеманн (Rammstein), Кори Тейлор (Slipknot), Адам Гонтьер (Three Days Grace), Кристина Скаббия (Lacuna Coil) и другие известные певцы, а также ударник Дэйв Ломбардо (Slayer) и гитарист Томояцу Хотей.

Apocalyptica выступала в качестве приглашённых гостей на Евровидении — 2007 во время подсчёта голосов. Группа сыграла одну новую вещь с ещё не вышедшего на тот момент альбома «Worlds Collide» и поппури на 2 свои песни — «Faraway» и «Life Burns».